博凯森提供生物信息学数据分析服务,包括 测序, 基因分型, 和 芯片实验等产生的数据.
高通量测序技术可生成大量且质量各异的数据,目前并不存在适用于所有情况的最优分析流程。我们专注于根据您的具体项目定制生物信息学分析流程。
我们的生物信息团队由具有博士学历的科学主页组成,专业背景涵盖计算机语言、统计学、生物信息学、遗传学和基因组学等,我们用于分析的软件基础架构结合了自研工具和开源软件。我们提供二代/三代测序数据的分析服务,提供可供文章发表的图表结果,并提供个性化的数据解读支持。博凯森提供的全套生物信息学服务助您数据分析一臂之力。
高通量测序技术能够产生海量的文本数据,因此并不存在适用于所有情况的最优的生物信息分析刘晨给。我们专注为您的具体项目制定的分析流程。根据您具体的分析需求,提供合适的项目分析方案并执行,充分发挥数据的价值.
|
NGS数据的一般生物信息学分析流程包括:碱基识别(依赖于平台)、去混合(可选步骤)、序列比对以及变异检测等分析. |
|
芯片数据的一般生物信息学分析流程包括:背景校正、归一化、基因表达模式聚类、类别预测,以及生物机制预测等分析. |
博凯森的生物信息学分析服务涵盖广泛的基因组学数据类型,包括但不限于 基因组学, 转录组学, 表观基因组学, and 芯片实验数据.
| 基因组数据分析服务(靶向、外显子组和全基因组测序) | 宏基因组学 | 转录组数据分析 | 表观基因组数据分析 | 三代基因组测序数据分析 | 单细胞RNA数据分析 | 芯片数据分析 |
| 1. Disegno in silico of gene panel | 1. RNA16S sequencing | 1. Sequence quality checks | 1. Analysis of ChIP-Seq data (transcription factors, histones) | 1. Quality Control and Error Correction | 1. Quality Control and Preprocessing | 1. Microarray data quality control |
| 2. Sequence quality checks | 2. Identification of microbial communities composition | 2. De-novo transcriptome assembly | 2. Analysis of bisulfite sequencing data (Methyl-Seq) | 2. Gene/Gene Isoform Expression | 2. Exploratory Analysis | 2. Differential expression analysis |
| 3. De-novo genome assembly | 3. Differential expression analysis of genes, isoforms and exons | 3. Differential methylation analysis in CpG and non-CpG regions | 3. Novel Gene Discovery and Full-Length Isoform Identification | 3. Cell Type Identification | ||
| 4. Sequence alignment versus reference genomes | 4. Analysis of fusion genes, circularized RNAs and trans-splicing events | 4. HiC analysis | 4. De Novo Fusion Gene Detection and Fusion Isoform Expression Profiles | 4.Trajectory Analysis | ||
| 5. Variant calling, annotation and prioritization (single samples, matched normal-tumor pairs, family trios) | 5. Detection of long non-coding RNAs | 5. Allele-Specific Expression and Haplotyping | 5.Integrative Single-cell Analyses | |||
| 6. Gene-ontology and pathway enrichment analysis | 6. Gene-ontology and pathway enrichment analysis | 6. De Novo Genome Assembly | 6. Ligand-Receptor Analysis | |||
| 7. Analysis of CNV and large rearrangements | 7. Gene expression-dependent survival analysis | 7. De Novo Transcriptome Assembly | 7. Spatial Transcriptomic Analysis | |||
| 8. Clonal evolution and heterogeneity in cancer | 8. Methylation Calling, Nucleosome Positioning, and Chromatin Accessibility |
标准分析:仅提供基础结果,不包括对实验背景的解释(如带注释的变异列表、差异表达基因及其统计数据、结合位点等)。该服务通常会产生一定的测序成本。
定制化分析:在提供结果的同时,由专主页提供深入解析,帮助设计研究方案,执行定制分析,优化数据展示方式等。
需要更详细的生物信息学服务的信息?或希望我们帮助分析您的数据分析?欢迎随时联系我们,我们将竭诚为您服务!
参考文献: