长读测序

博凯森生物 offers cutting-edge technologies and bioinformatics analysis services of long-read sequencing, which include PacBio SMRT测序 和 新型纳米孔测序法. We offer accurate and cost-effective sequencing solutions for humans, animals, plants, and microbial research.

长读测序介绍

长读测序,也称为第三代测序,是一组蓬勃发展的DNA测序技术,它消除了对传统测序技术DNA切割和扩增的需要,并允许同时检测高达100000个碱基对的长DNA序列。科学主页们已经意识到人类基因组中结构变异的重要性。其中一些是插入变异,超过了许多测序技术的读取长度;有些是重复区域,使序列比对变得困难;其中一些是富含GC的区域,这往往给通过短读测序方法研究结构变异带来许多不便。

近年来,出现了可以检测长读序列的新技术,为研究人员提供了基因组分析的新策略和工具。其中,最具代表性和应用最广泛的是PacBio SMRT测序和Nanopore测序。长读取测序技术可以产生非常长的读取,这在下一代测序中是不可能的。

PacBio推出了单分子实时测序(SMRT)的测序平台,该平台使用具有大量零模波导的定制流动池对单分子进行实时测序(ZMW)。聚合酶附着在孔的底部,使DNA链能够穿过ZMW。SMRT测序可以实时成像与特定DNA模板分子一起合成的荧光标记核苷酸。当框架和聚合酶分离时,测序反应完成。

Nanopore技术的核心要素分为从纳米孔形成允许离子电流通过的跨膜通道和测量电流变化。当DNA或RNA等分子穿过纳米孔时,它们会导致电流中断。关于电流变化的信息可用于识别分子。它直接对整个DNA/RNA分子进行测序。

主要特征和优势

  • 平均读取长度长,共识精度高
  • 提高了重复序列和拷贝数变化的准确性
  • 更准确地检测大量突变
  • 长读测序中DNA提取方案的优化
  • 与基因组和转录组分析兼容
  • 快速且经济实惠

工作流程

服务规范

样本类型
  • gDNA,总RNA,组织,细胞
测序服务策略
  • ONT平台,库:8K,2G/每个样本
  • PacBio平台,20 K库
应用
  • 基因功能:关注具有特定功能的样本,揭示不同功能的主要原因
  • 基因结构:选择性剪接、APA、融合基因、SSR、CDS预测、TSS/TES鉴定等。
  • 全长量化:寻找全面有效的差异基因并鉴定功能基因
  • 表观基因组学:直接全长基因组和转录组测序可以检测碱基修饰

博凯森生物提供全面的长读测序服务包,包括样品制备、文库构建、SMRT测序和/或纳米孔测序以及生物信息学分析。我们可以根据您的研究兴趣定制此管道。如果您有其他要求或问题,请随时与我们联系。

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