基因组数据分析

博凯森生物 专有GenSeq超在禅定 技术提供 基因组数据分析 服务。我们在帮助解决各种生物信息学问题方面拥有丰富的经验。

什么是基因组数据分析?

基因组数据分析包括仔细检查和解释生物体基因组中庞大的遗传信息库的复杂过程。基因组由整个DNA组成,跨越编码和非编码区域,构成了个体的遗传蓝图。为了揭示基因组数据中隐藏的见解,利用了复杂的生物信息学工具和计算技术,促进了有意义知识的提取。

基因组数据分析的基本目标是深入研究基因组的各个方面,包括基因、调控元件和功能成分的鉴定。此外,它需要理解遗传变异,探索种群和个体内的遗传关系。基因组数据分析的意义涵盖了广泛的研究学科,包括基因组学、遗传学、个性化医学、进化生物学和生物技术。

许多基本任务构成了基因组数据分析的格局:

序列比对:一个关键过程,涉及将DNA序列与参考基因组进行比较和比对,以揭示相似性和相异性。

变量调用: The discernment and annotation of genetic variations, such as single nucleotide polymorphisms (SNPs) and insertions/deletions (indels).

基因表达分析: Unraveling the intricacies of gene expression patterns across different tissues or under varying conditions.

功能注释阐明基因和调控元件的作用和功能,以揭示其生物学意义。

比较基因组学:在比较框架内整合不同物种的基因组,以研究进化关系并确定保守区域。

表观遗传学分析: Investigating DNA and histone modifications to comprehend gene regulation and decipher epigenetic changes.

基因组:从复杂的微生物群落中探索遗传物质,以辨别和表征不同的物种。

通路分析:仔细研究基因和蛋白质之间的相互作用,以深入了解生物通路和复杂的网络。

总之,基因组数据分析在解码生物体DNA中的遗传信息方面发挥着不可或缺的作用。它的意义广泛而深远,为我们遗传学和生物学知识的进步注入了活力。此外,它在多个领域都有实际应用,包括医学诊断、药物开发和农业研究。

Our Genomic Data Analysis Service Package

随着测序技术现在每次运行产生数百万次高质量的读取,处理序列数据已成为许多研究人员的一大障碍。在博凯森生物,我们拥有专门的生物信息学主页团队,他们在克服这些挑战以及研究人员每天面临的各种其他挑战方面拥有丰富的经验。我们提供以下基因组数据分析服务:

Genomic Data Analysis

从头测序 测序数据分析

重新 如果没有可用的参考序列,测序可用于对未鉴定的基因组进行测序,如果预计会有显著的变化,测序也可用于对已知的基因组进行测序服务。

从头测序分析的一般策略是对齐和合并来自更长DNA序列的短片段,以重建原始序列。从头测序项目通常需要多个文库和多轮精加工才能获得完整的基因组序列。

通过我们的从头测序数据分析服务,我们能够提供:

  1. 高质量参考基因组组装的生成
  2. 基因的结构和功能注释
  3. 基因主页族(即R基因)的鉴定和系统发育分析
  4. 生物合成预测
  5. 路径

注释与基因预测

一旦生物体的基因组被测序和组装,就必须鉴定基因,以了解基因组的功能内容。因此,基因预测和注释是基因组项目中最重要的步骤之一。注释的目的是识别基因组的关键特征,特别是蛋白质编码基因及其产物。

我们能够使用来自从头开始或重新测序项目的数据进行基因预测、大小非编码RNA注释、特定基因和蛋白质主页族和途径的鉴定。

基因组重测序数据分析

一旦你有了生物体的参考序列,你就可以利用下一代测序进行比较测序或重测序,以表征同一物种个体或相关物种之间的遗传变异。

通过我们的基因组重测序数据分析服务,我们能够提供:

  1. 识别小结构变异(SV),如SNP和DIP;
  2. 鉴定大SV样缺失、插入、重复、倒置、基因组重排、拷贝数变异(CNV)和存在缺失变异(PAV);
  3. 基因组共识重建;
  4. 全基因组关联研究;
  5. 高通量基因分型;
  6. 分子进化研究。

靶向和外显子组测序数据分析

由于与全基因组重测序相关的高测序和数据管理成本,靶向重测序提供了一种时间和成本效益高的替代方案。靶向重测序,包括外显子组测序,主要侧重于检测SNP和小Indels。

通过我们的靶向和外显子组测序数据分析服务,我们能够提供:

  1. 识别小结构变异(SV),如SNP和DIP;
  2. 鉴定大SV样缺失、插入、重复、倒置、基因组重排、拷贝数变异(CNV)和存在缺失变异(PAV);
  3. 全基因组关联研究;
  4. 高通量基因分型;
  5. 分子标记的高通量开发;
  6. 分子进化研究。

宏基因组测序数据分析

宏基因组学是研究整个微生物群落中包含的基因组。宏基因组测序侧重于微生物群落多样性分析、基因组成和功能,以及与特定环境相关的代谢途径。

通过我们的宏基因组测序数据分析服务,我们能够提供:

  1. 物种组成和丰度分析
  2. 基因组成分分析
  3. 生成非冗余基因目录
  4. 基因功能注释
  5. 样品间比较分析

分析案例:

仅供研究使用。不用于诊断程序。
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