长振幅分析（LAA）

Based on PacBio Circular Consensus Sequences (CCSs), polymerase could copy the same DNA region for several times, which generates high-fidelity, long reads (>99.9% single-molecule read accuracy). Long Amplicon Analysis (LAA) using Single Molecule, Real-Time (SMRT) Sequencing and the Sequel System produces highly accurate and phased CCSs from long amplicons.

图1。SMRT测序技术概述。 (来自Simon Ardui等人，2018)

与短读测序平台相比，PacBio的长读测序使得对大小从几百个碱基对到10 Kb的扩增子或捕获片段进行测序变得简单。这些长序列对于包括SNP、CNVs和其他通常不需要组装的结构变体在内的变体的可视化非常有用。

博凯森生物提供专业且经济高效的LAA服务，每个样本的测序深度从<500到10K CCS不等，以满足您的特定研究要求。

应用

• 全长16S/18S/ITS基因测序
• 全长HLA分型
• 替代单倍型
• 重新 靶基因组装
• 定制扩增子测序

样品要求

• 2 µg or more of amplicons (i.e. purified PCR Products) with a concentration of ~50ng/µl or higher, be dissolved in Tris-HCl buffer (10 mM, pH 8) and shipped on dry ice packs.  
• 我们还提供扩增子制备服务，从基因组DNA、细胞颗粒和组织等起始材料开始。

服务工作流

生物信息学分析

对于全长16S/18S/ITS基因测序：

• OTU集群和过滤
• OTU分析和物种注释
• 阿尔法多样性、贝塔多样性、荟萃分析
• 多元统计分析

其他申请请咨询。

参考文献

1. Simon Ardui, et al. (2018) Single molecule real-time (SMRT) sequencing comes of age: applications and utilities for medical diagnostics. Nucleic Acids Research. 46(5) 2159–2168. 
2. Joshua P. Earl, et al. (2018) Species-level bacterial community profiling of the healthy sinonasal microbiome using Pacific Biosciences sequencing of full- length 16S rRNA genes. Microbiome. 6.
3. Henk P.J. Buermans, et al. (2017) Flexible and Scalable Full-Length CYP2D6 Long Amplicon PacBio Sequencing. Human Mutation. 38(3) 310–316.