Genotyping by Sequencing (GBS)

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基因分型测序(GBS)简介

基因分型测序(Genotyping by Sequencing,GBS)属于简化基因组测序技术之一,是一种发现单核苷酸多态性(SNP)并进行基因分型研究的方法。GBS 通过限制性内切酶切割 DNA,结合带有条形码的接头,大幅降低基因组复杂度。通过选择合适的限制性酶,GBS 能在基因组富集区提供高覆盖率的 SNP,且成本效益极高,同时增加测序标签数量。由于限制性酶切位点在种群内通常保守,测序的基因组区域具有高度一致性,极适合需要大范围调查的实验。

因此,GBS 方法简单、快速、特异性强、高度重现,能够同时检测 SNP 和基因型,覆盖到捕获测序无法覆盖的重要基因组区域。该系统的关键优势包括低成本、减少样本操作、PCR 及纯化步骤少,无需片段大小筛选,无需参考序列限制,以及高效的条形码系统,且易于规模化。这些特性使 GBS 成为实施全基因组关联研究(GWAS)、基因多样性研究、遗传连锁分析、分子标记发现和大规模育种基因组选择的有力工具。

主要特点与优势

  • 减少样本处理步骤
  • PCR 和纯化步骤少
  • 无需 DNA 片段大小筛选
  • 高效的条形码系统
  • 同时完成标记发现与基因分型
  • 适合大规模应用

GBS 流程图

GBS 流程图

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