测序

几十年来，博凯森生物一直提供准确且价格合理的RNA-Seq（RNA测序）服务。我们结合 PacBio （长读） 重新 组装或重新测序服务 细菌植物、动物和人类。

RNA-Seq的介绍

RNA-Seq是利用下一代测序（NGS）绘制和量化转录组的首要工具

RNA-Seq提供了一个无偏见的、前所未有的全球转录格局的高分辨率视图 重新 新转录组的组装

RNA-Seq的优点

• 以单碱基对分辨率定量和精确测量RNA分子
• 发现新的转录本、剪接变体和基因融合
• 适用于任何物种，无论是否有参考基因组
• 与许多其他方法相比，价格相当或更低

RNA-Seq工作流程

博凯森生物结合了Illumina HiSeq和 PacBio 为任何物种提供快速准确的RNA-Seq和生物信息学分析。我们的高度

	样品要求和制备 RNA amount ≥ 2 μg, RNA concentration ≥ 50 ng/μl, OD260/280=1.8~2.0 所有RNA样本的纯度和数量都经过验证
	测序服务 常规：Illumina HiSeq PE150 差异基因表达研究：Illumina HiSeq 50 全文转录：PacBio SMRT More than 80% of bases with a ≥Q30 quality score
	生物信息学分析 我们提供定制的生物信息学分析，包括： 测序深度和覆盖率统计 重新 组装和参考基因组图谱 基因注释和基因表达水平 新RNA的预测和变异的鉴定 差异基因表达检测 等位基因特异性表达的评估 表达数量性状位点（eQTL）的鉴定

博凯森生物提供完整的RNA测序服务包，

1.每种情况我需要多少个生物复制品？

我们建议您每个样本至少提交3个重复样本，以提高置信度并减少实验误差。笔记

2.NGS比微阵列有什么优势？

已经开发了各种转录组分析技术，如微阵列和NGS。与…相比

i.RNA-Seq是基因表达谱分析的敏感工具。与微阵列相比，RNA-Seq提供了一种数字读取

ii。微阵列只能提供有限的基因表达信息（即掺入芯片的基因），

iii.NGS产生的结果比微阵列更具可重复性和可靠性。不需要进行qPCR

3.测序前什么时候需要消除rRNA？

核糖体RNA（rRNA）占总RNA的90%以上

4.RNA-Seq可以在没有可用参考基因组的原核物种中进行吗？

It’s better not. Prokaryotic species generally require reference genome for transcriptome analysis, since the mRNAs in them are usually polycistrons that do not suit for 重新 组装。

5.RNA-Seq数据分析的传统管道是什么？

RNA-Seq数据的常规管道包括原始数据质量控制、比对、组装、基因表达

图1。概述

参考：

1.Kukurba K R，Montgomery S B.RNA测序和分析。 冷泉港协议, 2015, 2015(11):

通过RNA测序对转录组进行表征，确定了转录组的一个主要分子和临床细分

期刊：基因组研究
影响系数：11.92
发布时间：2013年11月21日在线

摘要

作者对正常B淋巴细胞和慢性B淋巴细胞的不同亚群进行了深度RNA测序

结果

1.CLL基因表达谱

作者发现，CLL和正常B细胞之间有1089个基因差异表达（表1）。

表1。分析了不同组之间的表达和剪接差异。

图1。CLL转录景观。（A）编码潜力

2.CLL的拼接景观

作者鉴定出2000个基因，这些基因在选择性剪接异构体的相对比率上存在显著差异

图2:正常（N）和正常（P）之间BCR通路的剪接变化

3.CLL中的转录嵌合体

导致嵌合蛋白的基因融合是致癌的重要机制。作者

图3。

4.两个主要转录CLL亚群的鉴定

基于基因表达的RNA-seq样本的分层聚类可以清楚地将正常细胞与肿瘤分开

图4。主要的转录CLL亚群。（A）CLL和

5.C1和C2 CLL组的临床相关性

作者评估了C1和C2 CLL组的临床影响。与C1患者相比，C2患者的

图5。临床的

参考:

费雷拉P G，贾斯P，里科D， 等通过RNA测序对转录组进行表征，确定了一个主要的 基因组研究, 2014, 24(2): 212-226.