Amplicon测序服务

Amplicon测序基于NGS技术或 PacBio SMRT测序扩增子（PCR产物）的超深测序允许有效的变体鉴定和表征。该技术具有广泛的应用，包括 16S/18S/ITS基因测序, SNP基因分型, CRISPR测序体细胞/复杂变体发现， 抗体筛选测序, 免疫谱测序, 等.

Whether you would like to detect the diversity of microbial communities or discover rare somatic mutations in complex samples. 博凯森生物 could provide professional, cost-efficient and high-speed amplicon sequencing services to meet your project requirements.

主要特征和优势

• 通过超深测序提供高灵敏度的检测水平
• 通过对每个反应数十万个扩增子进行测序来实现高覆盖率
• Cost-efficient and fast turnaround time
• 微生物培养不是必需的
• 扩增子范围广，从100 bp到10 kb

样本类型

纯化或未纯化的PCR产物、片段DNA、gDNA、限制性内切酶切物质和质粒。

测序服务工作流程

图1测序工作流程。

推荐CD基因组测序策略

表1。扩增子测序策略。

• 数据质量控制
• OTU集群
• 阿尔法多样性（样本复杂性分析）
• 贝塔多样性（多样本比较分析，PCoA/PCA/NMDS/Simper）
• 组间物种差异分析（T检验/转移/LEfSe）
• 群体间群落结构差异分析（Anosim/MRPP/Adonis/Amova）
• 环境因素的相关性分析（斯皮尔曼/曼特尔检验/CCA/RDA/dbRDA/VPA）
• 网络分析
• 函数预测（PICRUSt/FAPROTAX/Tax4fun/FunGuild）
• 高级分析（肠型分析/贝叶斯分析）

图2变体识别的数据分析。

参考文献

1. Betge J，Kerr G，Miersch T， 等. 2015.癌症扩增子测序：冷冻和甲醛混合样本中的变异调用。普洛斯一号10:e0127146。
2. Ison SA、Delannoy S、Bugarel M， 等. 2016.附着和擦除单核苷酸多态性基因分型的靶向扩增子测序 大肠杆菌 O26:H11牛品系通过高通量文库制备技术。应用环境微生物学82:640-649。