泛基因组

泛基因组学导论

泛基因组是一个分支中所有菌株的整套基因，包括核心基因组和可变/辅助/可分配基因组。核心基因组由存在于所有菌株中的序列组成，通常与物种的生物学功能和主要表型特征有关，反映了物种的稳定性；可变/辅助/非必需基因组由仅存在于单个菌株或部分菌株中的序列组成，这些序列与物种对特定环境的适应性或独特的生物特征有关，反映了物种的特征。

泛基因组测序利用高通量测序和生物信息分析对物种的个体/亚种/谱系进行文库构建和深入测序，然后分别组装构建泛基因组图谱，丰富物种的遗传信息，研究其重要的生物学问题。

图1。泛基因组的组成

泛基因组的优势和特点

• 通过对亚种和个体进行测序，丰富物种的基因组信息
• 基于可变基因组研究，快速发现与重要性状相关的基因或基因结构变异
• 从独特基因序列的角度研究物种间的差异
• 人口少，节省成本和时间

泛基因组工作流程

分析管道

常问问题

• 全基因组测序需要多少个样本？

至少需要2个个体或亚种。

• 是否需要参考基因组？

有或没有参考基因组都是合适的。