全长转录测序（Iso-Seq）

博凯森生物在提供Iso-Seq服务方面拥有丰富的经验，无需组装即可生产全长转录本。对每一道工序都进行严格的质量控制，以确保结果全面准确。

……的介绍 等序列

在真核生物中，单个基因在交替剪接后可能编码数量惊人的蛋白质，每种蛋白质都具有不同的生物学功能。已知的人类基因根据表达的剪接变体具有非常不同的功能。选择性剪接对基因组功能至关重要。

短读RNA序列 works by physically shearing transcript isoforms into smaller pieces and reassembling, leaving possibilities for mis-assembly or incomplete capture of the full diversity of isoforms from genes of interest.  It’s important to capture full-length transcripts. By taking advantage of PacBio SMRT长读测序 技术，异构体测序（Iso-Seq）可以很容易地覆盖从5'端到3'-poly A尾的完整转录物，而不需要片段化来获得全长cDNA序列，这有助于鉴定新的转录物和新的内含子，从而准确鉴定异构体、选择性剪接位点、融合基因表达和等位基因表达。

与Illumina平台相比，PacBio分析可以很容易地检测到非常长的多顺反子RNA分子（称为复合转录物），并揭示平行排列的相邻和遥远基因之间的各种新的转录重叠。这有助于提高研究对基因表达和复制进行联合控制的全基因组网络的可能性。

项目工作流程

样品要求：

• RNA amount: Total RNA ≥ 5 ug (without degradation or DNA contamination)
• RNA purity: OD260/280 = 1.8~2.2; OD260/230 ≥ 1.5
• RNA quality: 28S:18S ≥ 1.5，RIN ≥ 7

测序服务策略：

PacBio平台，库类型>4K，6~10 G/每个样本

数据分析

无参考的成绩单

标准数据分析

• 全长同构分析，包括全长同构校正、分类、减少冗余
• 转录组注释，包括基因本体论、KEGG通路、KOG或COG、Swissport
• 基因结构分析，包括选择性剪接、LncRNA、SSR、CDS

高级数据分析

• 参考地图
• 基因表达水平分析
• 差异表达基因分析
• 差异表达转录组KEGG富集分析
• 差异表达基因热图
• … (more upon request)

带参考的成绩单

标准数据分析

• 全长同形分析，包括参考基因组作图、全长同形校正、分类、减少冗余
• 转录组注释，包括基因本体论、KEGG通路、KOG或COG、Swissport
• Gene Structures analysis, including alternative splicing, LncRNA, SSR, CDS, novel transcriptome prediction, Identification of fusion gene

高级数据分析

• 参考地图
• 基因表达水平分析
• 差异表达基因分析
• 差异表达转录组KEGG富集分析。
• 差异表达基因热图
• … (more upon request)

分析管道

长读测序 allows the straightforward identification of alternatively transcribed or processed transcripts, polycistronic transcription units, and other long cDNA sequences. With expertise and dedication, advanced PacBio SMRT platform and services from 博凯森生物 will be your best companion in Iso-Seq. Please contact us for more information and a detailed quote.