细菌RNA测序

除了真核生物 RNA测序 博凯森生物还致力于提供原核RNA测序服务，利用最新技术满足您的细菌基因表达谱分析需求。 细菌RNA测序介绍 近年来，cDNA文库的高通量测序(测序)已成为分析基因表达、发现以前未标记的基因和绘制各种细菌物种转录组结构的强大技术。随着应用 转录组测序 通过衍生方法，我们可以获得对细菌世界的生物学见解，并渴望揭开涉及基因表达、组织和其他功能基因组特征的奥秘。细菌转录组和 复转录体 信息对于预测对特定抗生素的耐药性、了解宿主-病原体免疫相互作用、量化基因表达变化和跟踪疾病进展非常重要。

There are obvious differences in cDNA library construction between bacterial RNA-Seq and Eukaryotic RNA-Seq. Bacterial RNA-Seq workflow’s first step is selection of mRNA transcripts. Ribo-Zero ribosomal RNA reduction chemistry is used in place a poly-A tail selection which makes this method particularly suited for bacteria mRNA lack a poly-A tail. Following purification, the mRNA is fragmented into small pieces, and copied into first strand cDNA using reverse transcriptase and random primers. Strand specificity is achieved by replacing dTTP with dUTP in the Second Strand Marking Mix (SMM), followed by second strand cDNA synthesis. Through the use of strand-specific RNA-Seq, a more complete understanding of the transcriptome could be achieved, this has the potential to identify new levels of regulation of gene expression.

项目工作流程

样品要求：

1. RNA amount: Total RNA≥3 ug (without degradation or DNA contamination)
2. RNA purity: OD260/280 = 1.8~2.2; OD260/230 ≥1.8
3. RNA quality: 28S:18S≥1.5，RIN≥7

测序服务策略：

HiSeq X十，150 PE，1~3 G/每个样品
MGI DNBSEQ-T7/DNBSEQ-G400

数据分析

无参考的成绩单

• 成绩单汇编
• 转录组/单基因长度统计
• 转录组功能注释，包括NR、NT、基因本体论、KEGG通路、KOG、Swissport、蛋白质主页族
• 微分表达式分析
• CDS预测解析
• SNP/InDel分析
• … (more upon request)

带参考的成绩单

• 成绩单汇编
• 转录组/单基因长度统计
• 转录组功能注释，包括NR、NT、基因本体论、KEGG通路、KOG、Swissport、蛋白质主页族
• 微分表达式分析
• CDS预测解析
• SNP/InDel分析
• … (more upon request)

博凯森生物提供从样品质量控制到全面数据分析的快速、一站式细菌RNA测序解决方案。请联系我们以获取更多信息和详细报价。