RNA甲基化测序服务

What Is RNA Modifications

RNA修饰在转录后基因表达的表观遗传调控中起着关键作用。虽然已经对m6A RNA修饰进行了广泛的研究,但各种其他类型的RNA修饰也参与了转录后基因表达的调控。这些包括m1A、m5C、m7G、2'-O-甲基化和ac4C乙酰化。值得注意的是,这些领域正在进行的研究继续产生高影响力的出版物。

博凯森生物在RNA修饰测序领域处于领先地位,为mRNA和各种非编码RNA提供全面的RNA修饰测序服务。我们的服务涵盖了一系列RNA修饰,包括m6A、m1A、m5C、m7G、ac4C和2'-O-甲基化,有助于深化对RNA修饰复杂格局的理解。

Jinghui Song et al,. ACS Chem. Biol. 2017(Jinghui Song et al,. ACS化学。生物。 2017)

RNA修饰检测方法

(1) m6A RNA甲基化测序:同时检测mRNA、lncRNA和环状RNA中m6A修饰的灵敏技术

定量和痕量m6A RNA甲基化测序(MeRIP/m6A序列)

m6A甲基化是一种广泛存在于真核生物中的RNA修饰,包括mRNA甚至病毒RNA。尽管早在20世纪70年代就有m6A修饰的报道,但关于其在RNA中的总体分布及其对基因表达调控的影响的全面了解仍然有限。2011年,第一个真正的RNA去甲基化酶FTO的发现重新引起了人们对mRNA/lncRNA甲基化的兴趣。

MeRIP, employing m6A-specific antibodies for enrichment followed by sequencing, is a method designed to investigate adenosine methylation modifications in RNA. EasyGene has independently developed a trace-level RNA methylation detection technology, enabling the reduction of sample input to 10-20 μg, with a minimum requirement of only 5 μg of total RNA. This advancement facilitates precise analysis of m6A modifications across various RNA species, including mRNA, lncRNA, and circular RNA.

(2) m5C RNA甲基化测序:亚硫酸氢盐处理用于m5C修饰水平的单碱基精确检测

m5C RNA甲基化(RNA BS-seq,m5C)

在众多RNA修饰中,m5C是一个被广泛研究的修饰。当存在于tRNA中时,m5C可以调节翻译;在rRNA上,它在核糖体生物合成过程中的质量控制中起着重要作用,当在mRNA上发现时,它会影响mRNA的结构、稳定性和翻译过程。

RNA BS-seq是一种检测m5C的强大技术。这种方法涉及用亚硫酸氢盐处理RNA,将未修饰的胞嘧啶(C)转化为尿嘧啶(U),而m5C修饰的胞胞嘧啶保持不变。通过后续的PCR,尿嘧啶被转化为胸腺嘧啶(T),从而可以区分m5C和C。结合高通量测序,RNA BS-seq能够全面检测整个转录组中的m5C修饰。

3. 测序分析:通过基于免疫沉淀的测序揭示RNA-蛋白质相互作用

RNA免疫沉淀测序(RIP-seq)是一种强大的方法,用于深入研究RNA-蛋白质相互作用的复杂景观,提供对RNA分子与其相互作用蛋白质之间动态关联的见解。这项技术依赖于通过免疫沉淀精确捕获RNA-蛋白质复合物,由针对感兴趣蛋白质的抗体促进。

RIP-seq在探索转录后基因调控方面具有重要意义,是鉴定特定蛋白质结合的RNA靶标的关键工具。免疫沉淀后,相关的RNA被精心分离并进行高通量测序,提供了积极参与蛋白质相互作用的RNA分子的全面图谱。这种方法在促进我们对基本细胞过程的理解方面发挥着关键作用,包括RNA加工、定位和稳定性。

4. 纳米孔RNA甲基化测序服务:以单核苷酸精度揭示RNA修饰模式的精细细节

我们的纳米孔RNA甲基化测序服务代表了一种先进的解决方案,旨在以无与伦比的精度揭示RNA修饰的细微差别。利用纳米孔测序技术的能力,该服务提供单核苷酸分辨率,促进对不同RNA修饰的鉴定和表征,包括m6A、m1A、m5C、m7G、ac4C和2'-O-甲基化。

该服务以捕捉各种RNA物种(包括mRNA和非编码RNA)中RNA修饰的细微差别而闻名,它利用纳米孔技术进行实时长读测序。这种方法确保了以更高的精度和灵敏度检测修改。我们的服务强调全面和高通量分析,使研究人员能够深入研究RNA修饰的动态领域,以深刻的见解揭示其功能含义。

5. 2'-O-甲基化序列:分析RNA分子中的2'-O-甲基化模式

我们的2'-O-甲基化-seq服务致力于阐明RNA分子中2'-O-甲酯化的复杂模式。这种修饰发生在核糖的2'-羟基上,在RNA的稳定性和功能中起着关键作用。该服务利用最先进的测序技术,提供有关2'-O-甲基化在不同RNA物种中分布的高分辨率数据,包括mRNA、lncRNA、pri-miRNA、tRNA和rRNA。

优先考虑准确性和效率,2'-O-甲基化-seq为RNA分子中2'-O-甲酯化位点的具体位置和丰度提供了有价值的见解。该服务擅长处理各种样本类型,确保对2'-O-甲基化事件的全面覆盖和稳健检测。研究人员可以依靠这项服务来探索2'-O-甲基化的微妙领域,揭示其在生物过程中的功能相关性和潜在影响。

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