全长16S/18S/ITS扩增子测序

凭借在测序方面的丰富经验,博凯森生物很自豪能为客户提供全长16S/18S/ITS

……的介绍 全长16S/18S/ITS放大器

16S rRNA基因在不同种类的细菌和古菌之间高度保守,其中包含9个

与细菌16S rRNA基因相似,真核18S rRNA基因具有保守和可变区。18秒

基于测序技术的发展, 16秒/18秒 是研究细菌和真菌分类学和分子系统发育的最佳工具。靠近 PacBio SMRT长读测序 技术,CD 可以提供全长16S/18S/ITS rRNA测序服务,更好地帮助您

特别是对于16S rRNA测序,PacBio SMRT序列的平均读取长度为10~18 K,可以

此外,18S rRNA(总长度1500-2000bp)和ITS(约400-900bp)也能够通过以下方式进行

项目工作流程

样品要求:

gDNA ≥100 ng
PCR Products ≥400 ng

测序服务策略:

PacBio Sequel平台,每个样本读取2000~20000个CCS读数

数据分析

  • OTU集群和过滤
  • OTU分析和物种注释
  • PCA,维恩图。将根据OTU丰度生成等级曲线
  • 阿尔法多样性、贝塔多样性、荟萃分析
  • 多元统计分析
  • … (more upon request)

生物信息学工作流程

长读测序能够实现物种水平的分辨率,并通过全长16S/18S/ITS驱动功能洞察 提供支持全长16S/18S/ITS rRNA测序服务的产品,

图1。

1.如何识别细菌种类?

将获得的16S rDNA序列与GenBank或Eztaxon上的参考16S rDNA序列进行比较。超过97%

2.样品要求。

  1. 如果您提交了培养的微生物,请确保它们已被纯化至少三次。和
  2. 如果您提交基因组DNA样本,则需要超过100纳克的数量。
  3. 对于革兰氏阳性微生物,请提交基因组DNA样本。
仅供研究使用。不用于诊断程序。
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