TCR-Seq

多项研究已证实，T细胞受体（TCR）库可作为监测免疫反应的生物标志物。BOKAISEN 开发了先进的高通量测序方法（TCR-Seq），用于精准解析 TCR 库。

TCR 位于 T 细胞表面，负责识别抗原-MHC（主要组织相容性复合物）分子。TCR 的巨大多样性来源于可变区（V）、多样性区（D）和连接区（J）基因的重组，这对适应性免疫系统至关重要。通过对 TCR 库的测序与分析，可更深入理解适应性免疫反应，有助于新型感染因子的发现，并为抗体或疫苗开发、临床诊断、治疗与预防提供重要线索。

TCR 由多数 T 细胞表达的 αβ 链，或少数（1–5%）外周血 T 细胞表达的 γδ 链组成。每条 TCR 链包含三个高变区——互补决定区（CDR1–3）。其中 CDR3 是由 V 与 J 或 D 与 J 基因之间的连接区域编码的，因此具有极高的变异性。此外，CDR3 是直接与肽抗原接触的区域，在 TCR 与肽-MHC 复合物的相互作用中起关键作用，因而成为 TCR 库研究的首选靶区。

图1. T细胞受体的功能与组成（Rosati 等, 2017）。

我们的 TCR-Seq 服务整合了主流的高通量测序平台和生物信息学分析技术，能够以前所未有的高分辨率描绘 TCR 库图谱，为揭示抗原刺激过程中克隆群体的动态变化提供了巨大潜力。TCR-Seq 策略通过多重PCR、5' RACE 或靶向捕获等方式富集 CDR3 区域，随后进行深度测序与数据分析。下图展示了该策略的总体流程。

图2. TCR-seq 流程示意图。

服务特点

• 适用于多种物种，包括人类和小鼠
• 接受多种样本类型，包括RNA、DNA、T细胞、血液、组织等
• 多种灵活测序配置可选，如 Illumina MiSeq PE300、HiSeq PE150/250

生物信息学分析

• 原始数据质控
• 与 IMGT 数据库比对
• CDR3 氨基酸丰度分析
• CDR3 长度分布分析
• V 基因使用频率分析
• V(D)J 组合频次统计
• 多样性指数分析
• 可根据需求定制分析内容，欢迎咨询

参考文献

• Rosati E, et al. Overview of methodologies for T-cell receptor repertoire analysis. BMC Biotechnology. 2017, 17(61).
• Cui J. H, et al. TCR repertoire as a novel indicator for immune monitoring and prognosis assessment of patients with cervical cancer. Front. Immunol. 2018, 9(2729).