单细胞DNA甲基化测序

博凯森提供单细胞 DNA 甲基化分析服务，以解析全基因组范围内 5-甲基胞嘧啶（5mC）模式的细胞异质性。

单细胞 DNA 甲基化测序简介

DNA 甲基化是正常发育和基因表达调控中的核心机制。它在维持细胞身份方面发挥关键作用，并参与多种生物学过程，包括基因组印记、X 染色体失活、转座子抑制、衰老及癌症发生等。当前研究 DNA 甲基化的常规方法多为群体水平测序，如 全基因组亚硫酸氢盐测序（WGBS）, 简化代表性亚硫酸氢盐测序（RRBS）, 以及 MeDIP甲基化富集测序等. 我们结合高度创新的单细胞 WGBS 文库构建技术与 Illumina 下一代测序平台，实现对单个细胞甲基化状态的可视化。单细胞全基因组亚硫酸氢盐测序可揭示在常规群体测序中被掩盖的细胞间异质性。我们提供高效简化的 WGBS 文库构建流程，DNA 在首次亚硫酸氢盐处理步骤中被随机片段化，随后进行文库构建。该流程适用于极低 DNA 输入样本，特别适合对宝贵、数量有限或靶向富集样本的甲基化研究。

单细胞DNA甲基化测序流程

采用亚硫酸氢盐处理后的文库构建方案，可在数小时内完成整体流程。以下为单细胞甲基化测序的一般流程概述：（此处建议配合图示展示具体步骤）

	样本要求 建议使用96孔板形式的活细胞悬液进行本流程操作。 也可使用特定裂解液冻存的细胞作为起始材料。 提取得到的DNA需>100 pg ，且应无酶抑制剂污染，可溶于水、TE缓冲液或低盐缓冲液中。
	测序 灵活的服务选项包括使用 HiSeq X
	生物信息学分析 基于参考基因组的比对 测序深度与覆盖度分析 甲基化位点（mC）识别 甲基化水平分析 全局甲基组趋势分析 甲基化密度分析 差异甲基化区域（DMRs）分析 DMR注释与富集分析（GO/KEGG） 聚类分析

交付内容

• 原始测序数据
• 实验结果
• 数据分析报告
• 单细胞测序相关的详细信息（可根据写作或项目需求定制

博凯森的单细胞测序服务聚焦于揭示组织中细胞变异与器官功能之间的关联，进一步阐明疾病的起源。如您有其他需求或疑问，欢迎随时与我们联系。

Reference

Gravina, S et al. Single-cell genome-wide bisulfite sequencing uncovers extensive heterogeneity in the mouse liver methylome. Genome Biology, 2016 17(1):150.