Single-cell RNA Sequencing

博凯森提供高质量样本下至单个细胞水平的稳健转录组研究服务。这些来源于单细胞的全基因表达模式已极大地推动了细胞生物学的发展。

单细胞RNA测序简介

细胞是生命的基本单位，每个细胞都是独一无二的。揭示生物系统中复杂的细胞事件，对于深入理解细胞在发育过程或疾病进展中的作用至关重要。针对由混合细胞群体组成的样本开展单细胞分辨率的基因表达研究，可以深入洞察不同细胞类型在转录组层面的复杂性。

博凯森提供一流的文库构建和测序工具，适用于单个细胞、少量细胞及超低输入RNA样本。结合稳健的cDNA合成技术与Illumina高通量测序及分析技术，我们为研究者提供高质量、可靠的数据，以研究细胞间的转录组异质性。

单细胞RNA测序流程

随着细胞分选/分离技术（如流式细胞术和微流控技术）的出现，捕获单个细胞并对其DNA或RNA进行扩增以实现单细胞测序成为可能。以下为单细胞RNA测序的一般流程。

技术说明

Fluidigm C1 单细胞mRNA测序流程：借助 Fluidigm C1 系统，我们可按需提供单细胞转录组分析服务。C1 系统可快速可靠地捕获和处理单个细胞。C1单细胞mRNA测序整合流程包括：使用流体通路芯片（IFCs）捕获细胞，将polyA+ RNA转化为全长cDNA，并对cDNA进行通用扩增。借助可定制的微流控芯片，C1 可无缝完成从关键细胞群体识别到文库构建的转化，支持3'端计数测序、全长mRNA测序、DNA测序、表观遗传分析、microRNA表达分析等多种下游应用。

SMART-seq 超低输入RNA测序技术：SMART 技术可提供全长转录本信息，支持转录本剪接变体、基因融合、点突变等的分析。该技术所用试剂盒可直接从 1–1000 个完整细胞或超低输入总RNA合成cDNA，具有高重复性，并可准确表达富含GC区域的转录本。利用该试剂盒构建的全长cDNA文库兼容 Illumina 平台。

服务规范

	样本要求 建议使用96孔板中悬浮的活细胞进行该实验流程。 也可使用特定冻存裂解液中的冻存细胞作为起始材料。 >100 pg 提取RNA，OD260/280比值应在1.8到2.0之间
	测序 多种测序平台可选包括 HiSeq X 和 MGI DNBSEQ-T7/DNBSEQ-G400
	生物信息学分析 原始数据质控 测序深度和覆盖度统计 SNP/InDel/SV/CNV 变异检测 功能注释与统计 通路富集分析 群体遗传学分析 可根据需求进行更多数据挖掘

交付内容

• 原始测序数据
• 实验结果
• 数据分析报告
• 适用于您的撰写工作的单细胞测序技术细节（可定制）

博凯森的单细胞测序服务聚焦于组织中细胞变异与器官功能之间的联系，进一步阐明疾病的起源。如您有其他需求或疑问，欢迎随时联系我们。

参考文献

1. Wu, AR et al. Quantitative assessment of single-cell RNA-sequencing methods. Nature Methods. 2014 January; 11(1): 41–46.
2. Picelli, S et al. Full-length RNA-seq from single cells using Smart-seq2.Nature Protocols. 2014 Jan;9(1):171-81.